En lo deportivo, la temporada transcurrió con relativa tranquilidad, consiguiéndose la salvación en la jornada 34 tras la victoria por 1-0 ante la Unión Deportiva Las Palmas y logrando una 10º posición en la tabla clasificatoria. Durante la temporada 2013-14, con la llegada de Pep Guardiola Rafinha encontró más oportunidades de jugar con regularidad, camiseta fc barcelona debido a que Pep decidió que su compañero Philipp Lahm fuera a jugar a la mitad de la cancha.
